TNFRSF1A

TNFRSF1A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1EXT, 1FT4, 1ICH, 1NCF, 1TNR
Ідентифікатори
Символи	TNFRSF1A, CD120a, FPF, MS5, TBP1, TNF-R, TNF-R-I, TNF-R55, TNFAR, TNFR1, TNFR1-d2, TNFR55, TNFR60, p55, p55-R, p60, tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, TNF receptor superfamily member 1A
Зовнішні ІД	OMIM: 191190 MGI: 1314884 HomoloGene: 828 GeneCards: TNFRSF1A
Пов'язані генетичні захворювання
розсіяний склероз, первинний біліарний холангіт, autosomal dominant familial periodic fever
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor-activated receptor activity • tumor necrosis factor binding • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • receptor complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • cell surface • мітохондрія • membrane raft • міжклітинний простір • tumor necrosis factor receptor superfamily complex Біологічний процес • regulation of apoptotic process • prostaglandin metabolic process • defense response • positive regulation of ceramide biosynthetic process • positive regulation of inflammatory response • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • response to lipopolysaccharide • cellular response to mechanical stimulus • death-inducing signaling complex assembly • regulation of cell population proliferation • defense response to bacterium • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0022415 viral process • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of inflammatory response • regulation of establishment of endothelial barrier • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • inflammatory response • cell surface receptor signaling pathway • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • protein localization to plasma membrane • cytokine-mediated signaling pathway • aortic valve development • pulmonary valve development • negative regulation of extracellular matrix constituent secretion • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy • positive regulation of apoptotic process involved in morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7132	21937
Ensembl	ENSG00000067182	ENSMUSG00000030341
UniProt	P19438	P25118
RefSeq (мРНК)	NM_001065 NM_001346091 NM_001346092	NM_011609
RefSeq (білок)	NP_001056 NP_001333020 NP_001333021	NP_035739
Локус (UCSC)	Хр. 12: 6.33 – 6.34 Mb	Хр. 6: 125.33 – 125.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNFRSF1A (англ. TNF receptor superfamily member 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 455 амінокислот, а молекулярна маса — 50 495.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLSTVPDLL		LPLVLLELLV		GIYPSGVIGL		VPHLGDREKR		DSVCPQGKYI
HPQNNSICCT		KCHKGTYLYN		DCPGPGQDTD		CRECESGSFT		ASENHLRHCL
SCSKCRKEMG		QVEISSCTVD		RDTVCGCRKN		QYRHYWSENL		FQCFNCSLCL
NGTVHLSCQE		KQNTVCTCHA		GFFLRENECV		SCSNCKKSLE		CTKLCLPQIE
NVKGTEDSGT		TVLLPLVIFF		GLCLLSLLFI		GLMYRYQRWK		SKLYSIVCGK
STPEKEGELE		GTTTKPLAPN		PSFSPTPGFT		PTLGFSPVPS		STFTSSSTYT
PGDCPNFAAP		RREVAPPYQG		ADPILATALA		SDPIPNPLQK		WEDSAHKPQS
LDTDDPATLY		AVVENVPPLR		WKEFVRRLGL		SDHEIDRLEL		QNGRCLREAQ
YSMLATWRRR		TPRREATLEL		LGRVLRDMDL		LGCLEDIEEA		LCGPAALPPA
PSLLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, апараті гольджі. Також секретований назовні.

Література

• Gray P.W., Barrett K., Chantry D., Turner M., Feldman M. (1990). Cloning of human tumor necrosis factor (TNF) receptor cDNA and expression of recombinant soluble TNF-binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 7380—7384. PMID 2170974 doi:10.1073/pnas.87.19.7380
• Fuchs P., Strehl S., Dworzak M., Himmler A., Ambros P.F. (1992). Structure of the human TNF receptor 1 (p60) gene (TNFR1) and localization to chromosome 12p13. Genomics. 13: 219—224. PMID 1315717 doi:10.1016/0888-7543(92)90226-I
• Wang P., Yu P., Gao P., Shi T., Ma D. (2009). Discovery of novel human transcript variants by analysis of intronic single-block EST with polyadenylation site. BMC Genomics. 10: 518—518. PMID 19906316 doi:10.1186/1471-2164-10-518
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Sanz L., Sanchez P., Lallena M.-J., Diaz-Meco M.T., Moscat J. (1999). The interaction of p62 with RIP links the atypical PKCs to NF-kappaB activation. EMBO J. 18: 3044—3053. PMID 10356400 doi:10.1093/emboj/18.11.3044
• Hildt E., Oess S. (1999). Identification of Grb2 as a novel binding partner of tumor necrosis factor (TNF) receptor I. J. Exp. Med. 189: 1707—1714. PMID 10359574 doi:10.1084/jem.189.11.1707

Див. також

• Хромосома 12