SP110

SP110
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UFN
Ідентифікатори
Символи	SP110, IFI41, IFI75, IPR1, VODI, SP110 nuclear body protein
Зовнішні ІД	OMIM: 604457 MGI: 3783243 HomoloGene: 82192 GeneCards: SP110
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, hepatic veno-occlusive disease with immunodeficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • signal transducer activity • зв’язування з іоном металу • зв'язування з ДНК • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ДНК-матрична транскрипція • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3431	101056250
Ensembl	ENSG00000135899	н/д
UniProt	Q9HB58	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001185015 NM_004509 NM_004510 NM_080424 NM_001378442 NM_001378443 NM_001378444 NM_001378445 NM_001378446 NM_001378447	н/д
RefSeq (білок)	NP_001171944 NP_004500 NP_004501 NP_536349 NP_001365371 NP_001365372 NP_001365373 NP_001365374 NP_001365375 NP_001365376	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 2: 230.17 – 230.23 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SP110 (англ. SP110 nuclear body protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 689 амінокислот, а молекулярна маса — 78 396.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFTMTRAMEE		ALFQHFMHQK		LGIAYAIHKP		FPFFEGLLDN		SIITKRMYME
SLEACRNLIP		VSRVVHNILT		QLERTFNLSL		LVTLFSQINL		REYPNLVTIY
RSFKRVGASY		EWQSRDTPIL		LEAPTGLAEG		SSLHTPLALP		PPQPPQPSCS
PCAPRVSEPG		TSSQQSDEIL		SESPSPSDPV		LPLPALIQEG		RSTSVTNDKL
TSKMNAEEDS		EEMPSLLTST		VQVASDNLIP		QIRDKEDPQE		MPHSPLGSMP
EIRDNSPEPN		DPEEPQEVSS		TPSDKKGKKR		KRCIWSTPKR		RHKKKSLPGG
TASSRHGIQK		KLKRVDQVPQ		KKDDSTCNST		VETRAQKART		ECARKSRSEE
IIDGTSEMNE		GKRSQKTPST		PRRVTQGAAS		PGHGIQEKLQ		VVDKVTQRKD
DSTWNSEVMM		RVQKARTKCA		RKSRLKEKKK		EKDICSSSKR		RFQKNIHRRG
KPKSDTVDFH		CSKLPVTCGE		AKGILYKKKM		KHGSSVKCIR		NEDGTWLTPN
EFEVEGKGRN		AKNWKRNIRC		EGMTLGELLK		RKNSDECEVC		CQGGQLLCCG
TCPRVFHEDC		HIPPVEAKRM		LWSCTFCRMK		RSSGSQQCHH		VSKTLERQMQ
PQDQLIRDYG		EPFQEAMWLD		LVKERLITEM		YTVAWFVRDM		RLMFRNHKTF
YKASDFGQVG		LDLEAEFEKD		LKDVLGFHEA		NDGGFWTLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 doi:10.1021/pr800500r
• Kadereit S., Gewert D.R., Galabru J., Hovanessian A.G., Meurs E.F. (1993). Molecular cloning of two new interferon-induced, highly related nuclear phosphoproteins. J. Biol. Chem. 268: 24432—24441. PMID 7693701

Див. також

• Хромосома 2